Международный фонд спасения Арала (МФСА) был учрежден в 1993 году по предложению лидера Казахстана Нурсултана Назарбаева, который остро отметил проблему зоны Аральского моря. Идею о создании специального фонда, направленного на решение этой проблемы, поддержали главы центральных азиатских государств в Ташкенте 4 января 1993 года.

МФСА с тех пор успешно существует и по сей день, и в 2013 году срок ее работы стал равен двадцати годам. За это время организация значительно продвинулась в работе над поставленной ею проблемой. МФСА удалось привлечь к проблеме зоны бассейна Аральского моря и трансграничных территорий широкое внимание общественности и мирового сообщества. Усилиями фонда на данный момент кризис Арала практически преодолен. Происходило и происходит это до сих пор не без участия значимых организаций мирового сообщества: ООН с ее программой развития и экологической программой, ЮНЕСКО, Всемирного Банка, ОБСЕ, Азиатского банка развития и ТАСИС. Кроме того, в обозначенной проблеме приняли участие правительства стран-доноров, таких, как Нидерланды, Германия, Израиль, Дания, Канада, США, Швейцария и другие страны.

В конференции под названием «Международный фонд спасения Арала: двадцать лет на пути сотрудничества» приняли участие более двух сотен делегатов из стран Центральной Азии – Казахстана, Туркменистана, Узбекистана, Таджикистана и Кыргызстана. В ходе конференции обсуждались вопросы сотрудничества и взаимодействия в социальных, экономических и экологических сферах, касающихся территорий Аральского моря, а также были обговорены вопросы по совместному управлению территорией бассейна Аральского моря, реками, которые туда входят, и водными ресурсами, которыми они располагают.

Совместные действия по спасению ситуации с Аральским морем, усиленные созданием и работой МФСА, во многом повернули вспять критическую ситуацию, сложившуюся на данной территории с экологическими ресурсами. Аральское море и реки, входящие в его бассейн, во многом определяют экономическую и экологическую жизнь трансграничных регионов и населения, живущего на этой территории.